实验室中，根据房间的特性与条件及要达到的通风效果，可将通风柜分为多种类型：
补风型通风柜有空气调节系统的洁净实验室或实验室，用这种通风柜既节省了能耗，又不影响实验室内本身的的空气质量。
项抽式通风柜比较适用于有热量产生需要制冷的实验室，结构比较简单、制造也方便。
活动式通风柜在现代化实验室建筑中，有时还配置一种通用实验室（实验大厅），其中的实验工作台、水盆通风柜等设备都可随时移动，不用时也可推入邻近的贮藏室。这种通风柜宜用木材、塑料或轻金属制作以便移动。
狭缝式通风柜结构复杂，制作也较麻烦，在它的后侧跟顶部装了排风狭缝，对各种不同工况都能获得良好的效果。
自然通风式通风柜的好处是不耗电，能不分白天黑夜都能换气，没有振动和噪音，投资成本低，结构简单，容易维护。但是它只适用于毒性低和不产生热量的实验，有的地方夏天太热也不能用。
旁通式通风柜适用于幅度通风柜排除室内空气，当通风柜完全关闭时不影响实验室内的换气量。
当然，每种通风柜的工作方式，使用的面积，和风力的大小都不一样，价格也不一样，在选择时，应当根据具体的实验室环境选择合适的通风柜。